Στοιχεία Εργασίας

Τίτλος (Ελληνικά)

Τίτλος (Αγγλικά)

Περιγραφή Οι πρόσφατες εξελίξεις σε μεθόδους βαθιάς μηχανικής μάθησης έχουν οδηγήσει σε σημαντικές εξελίξεις στο πεδίο της βιολογίας και της φαρμακευτικής. Ένα πρόσφατο παράδειγμα αποτελεί το σύστημα Alphafold το οποίο παρουσιάστηκε το 2021, το οποίο μπορεί και προβλέπει με μεγάλη επιτυχία τη δομή πρωτεϊνών, έχοντας διαθέσιμη μόνο την ακολουθία των αμινοξέων τους, μια διαδικασία η οποία παραδοσιακά είναι πειραματική, χρονοβόρα, και έχει μεγάλο κόστος. Τέτοιες μέθοδοι ανοίγουν μεγάλες δυνατότητες για το σχεδιασμό φαρμάκων για την αντιμετώπιση ασθενειών, έχοντας γνώση μόνο ορισμένων βιολογικών χαρακτηριστικών του στόχου (π.χ., ενός ιού). Στην εργασία αυτή θα γίνει εκτενής βιβλιογραφική επισκόπηση και κατανόηση τέτοιων μεθόδων. Θα επιλεγούν ορισμένες από αυτές και θα αξιολογηθούν πειραματικά σε κάποιο αναγνωρισμένο benchmark, όπως το DrugOOD https://drugood.github.io/ και το TDCommons (https://tdcommons.ai/).

Προσφέρεται σε: ΠΜΣ Πληροφορική και Τηλεματική Προηγμένες Τεχνολογίες Πληροφορικής και Εφαρμογές ΠΜΣ Εφαρμοσμένη Πληροφορική Προπτυχιακό Πρόγραμμα Σπουδών ΠΜΣ Επιστήμη των Υπολογιστών και Πληροφορική

Επιβλέπων --------- Ηλίας Παναγιωτόπουλος (Εξωτερικός Διδάσκων) Συμεών Παπαδόπουλος (Ερευνητής Γ' Βαθμίδας) Γιώργος Χατζηθανάσης (Εξωτερικός Διδάσκων) Ευαγγελία Φιλιοπούλου (Διδάσκων (με απόσπαση)) Δημοσθένης Κωτσόπουλος (Εξωτερικός Διδάσκων) Ιωάννης Κοντόπουλος (Εξωτερικός Διδάσκων) Γεώργιος Κάπος (Εξωτερικός Διδάσκων) Κωσταντίνα Βασιλοπούλου (Λέκτορας) Κωνσταντίνος Τσερπές (Αναπληρωτής Καθηγητής) Άγγελος Χαραλαμπίδης (Επίκουρος Καθηγητής) Δημοσθένης Αναγνωστόπουλος (Καθηγητής) Γεώργιος Μαλινδρέτος (Εξωτερικός Διδάσκων) Σωτήρης Ξύδης (Επίκουρος Καθηγητής) Γεώργιος Πετρόπουλος (Επίκουρος Καθηγητής) Θωμάς Καμαλάκης (Καθηγητής) Παναγιώτης Ριζομυλιώτης (Αναπληρωτής Καθηγητής) Χρύσα Σοφιανοπούλου (Καθηγήτρια) Ιωάννης Βιόλος (Εξωτερικός Διδάσκων) Ηρακλής Βαρλάμης (Καθηγητής) Μαυρέτα Σταμάτη (Αναπληρώτρια Καθηγήτρια) Παναγιώτης Κουρουθανάσης (Εξωτερικός Διδάσκων) Γεώργιος Παπαδόπουλος (Επίκουρος Καθηγητής) Φωτεινή Δανελη (ΕΤΕΠ) Γεώργιος Δημητρακόπουλος (Καθηγητής) Ηλίας Κατσαγούνος (Εξωτερικός Διδάσκων) Κλεοπάτρα Μπαρδάκη (Αναπληρώτρια Καθηγήτρια) Αντώνης Μακρής (Εξωτερικός Διδάσκων) Γεωργία Δέδε (Επίκουρη Καθηγήτρια) Ναούμ Μυλωνάς (Εξωτερικός Διδάσκων) Αδαμαντία Πατέλη (Εξωτερικός Διδάσκων) Ειρήνη Λιώτου (Επίκουρη Καθηγήτρια) Δήμητρα Λυπιτάκη (Εξωτερική Διδάσκεων) Χρήστος Δίου (Αναπληρωτής Καθηγητής) Αλέξανδρος Δημόπουλος (Εξωτερικός Διδάσκων) Μαλβίνα Βαμβακάρη (Καθηγητής) Γεώργιος Κουσιουρής (Αναπληρωτής Καθηγητής) Γιώργος Φραγκιαδάκης (Εξωτερικός Διδάσκων) Σπυριδούλα Λάκκα (Εξωτερικός Διδάσκων) Χρήστος Σαρδιανός (Εξωτερικός Διδάσκων) Νικόλαος Γεωργόπουλος (Εξωτερικός Διδάσκων) Κωνσταντίνος Βασιλάκης (Εξωτερικός Διδάσκων) Μάρα Νικολαίδου (Καθηγητής) Ιωάννης Ρούτης (Εξωτερικός Διδάσκων) Ανάργυρος Τσαδήμας (ΕΔΙΠ) Χρύσα Αγαπητού (Εξωτερικός Διδάσκων) Βασίλειος Ευθυμίου (Επίκουρος Καθηγητής) Χρήστος Μιχαλακέλης (Αναπληρωτής Καθηγητής) Δημήτριος Μιχαήλ (Αναπληρωτής Καθηγητής) Ευαγγελία Δράκου (Επίκουρη Καθηγήτρια) Νεκτάριος Μακρυδάκης (Εξωτερικός Διδάσκων) Παναγιώτης Μιχαήλ (Εξωτερικός Διδάσκοντας) Χρήστος Ανδρίκος (Εξωτερικός Διδάσκων) Νίκος Ζομπάκης (Εξωτερικός Διδάσκων) Αλεξάνδρα Γασπαρινάτου (ΕΔΙΠ) Αντωνία Ματάλα (Καθηγήτρια) Αικατερίνη Αντωνοπούλου (Αναπληρώτρια Καθηγήτρια) Ιωάννης Πάγκαλος (Επίκουρος Καθηγητής) Δημήτριος Ζμπαινος (Αναπλ. Καθηγητής) Βασίλειος Δαλάκας (ΕΔΙΠ) Ελένη Καλαμπαλίκη (ΕΤΕΠ) Ευθύμιος Χονδρογιάννης (Εξωτερικός Διδάσκοντας)

2ο Μέλος Επιτροπής --------- Ηλίας Παναγιωτόπουλος (Εξωτερικός Διδάσκων) Συμεών Παπαδόπουλος (Ερευνητής Γ' Βαθμίδας) Γιώργος Χατζηθανάσης (Εξωτερικός Διδάσκων) Ευαγγελία Φιλιοπούλου (Διδάσκων (με απόσπαση)) Δημοσθένης Κωτσόπουλος (Εξωτερικός Διδάσκων) Ιωάννης Κοντόπουλος (Εξωτερικός Διδάσκων) Γεώργιος Κάπος (Εξωτερικός Διδάσκων) Κωσταντίνα Βασιλοπούλου (Λέκτορας) Κωνσταντίνος Τσερπές (Αναπληρωτής Καθηγητής) Άγγελος Χαραλαμπίδης (Επίκουρος Καθηγητής) Δημοσθένης Αναγνωστόπουλος (Καθηγητής) Γεώργιος Μαλινδρέτος (Εξωτερικός Διδάσκων) Σωτήρης Ξύδης (Επίκουρος Καθηγητής) Γεώργιος Πετρόπουλος (Επίκουρος Καθηγητής) Θωμάς Καμαλάκης (Καθηγητής) Παναγιώτης Ριζομυλιώτης (Αναπληρωτής Καθηγητής) Χρύσα Σοφιανοπούλου (Καθηγήτρια) Ιωάννης Βιόλος (Εξωτερικός Διδάσκων) Ηρακλής Βαρλάμης (Καθηγητής) Μαυρέτα Σταμάτη (Αναπληρώτρια Καθηγήτρια) Παναγιώτης Κουρουθανάσης (Εξωτερικός Διδάσκων) Γεώργιος Παπαδόπουλος (Επίκουρος Καθηγητής) Φωτεινή Δανελη (ΕΤΕΠ) Γεώργιος Δημητρακόπουλος (Καθηγητής) Ηλίας Κατσαγούνος (Εξωτερικός Διδάσκων) Κλεοπάτρα Μπαρδάκη (Αναπληρώτρια Καθηγήτρια) Αντώνης Μακρής (Εξωτερικός Διδάσκων) Γεωργία Δέδε (Επίκουρη Καθηγήτρια) Ναούμ Μυλωνάς (Εξωτερικός Διδάσκων) Αδαμαντία Πατέλη (Εξωτερικός Διδάσκων) Ειρήνη Λιώτου (Επίκουρη Καθηγήτρια) Δήμητρα Λυπιτάκη (Εξωτερική Διδάσκεων) Χρήστος Δίου (Αναπληρωτής Καθηγητής) Αλέξανδρος Δημόπουλος (Εξωτερικός Διδάσκων) Μαλβίνα Βαμβακάρη (Καθηγητής) Γεώργιος Κουσιουρής (Αναπληρωτής Καθηγητής) Γιώργος Φραγκιαδάκης (Εξωτερικός Διδάσκων) Σπυριδούλα Λάκκα (Εξωτερικός Διδάσκων) Χρήστος Σαρδιανός (Εξωτερικός Διδάσκων) Νικόλαος Γεωργόπουλος (Εξωτερικός Διδάσκων) Κωνσταντίνος Βασιλάκης (Εξωτερικός Διδάσκων) Μάρα Νικολαίδου (Καθηγητής) Ιωάννης Ρούτης (Εξωτερικός Διδάσκων) Ανάργυρος Τσαδήμας (ΕΔΙΠ) Χρύσα Αγαπητού (Εξωτερικός Διδάσκων) Βασίλειος Ευθυμίου (Επίκουρος Καθηγητής) Χρήστος Μιχαλακέλης (Αναπληρωτής Καθηγητής) Δημήτριος Μιχαήλ (Αναπληρωτής Καθηγητής) Ευαγγελία Δράκου (Επίκουρη Καθηγήτρια) Νεκτάριος Μακρυδάκης (Εξωτερικός Διδάσκων) Παναγιώτης Μιχαήλ (Εξωτερικός Διδάσκοντας) Χρήστος Ανδρίκος (Εξωτερικός Διδάσκων) Νίκος Ζομπάκης (Εξωτερικός Διδάσκων) Αλεξάνδρα Γασπαρινάτου (ΕΔΙΠ) Αντωνία Ματάλα (Καθηγήτρια) Αικατερίνη Αντωνοπούλου (Αναπληρώτρια Καθηγήτρια) Ιωάννης Πάγκαλος (Επίκουρος Καθηγητής) Δημήτριος Ζμπαινος (Αναπλ. Καθηγητής) Βασίλειος Δαλάκας (ΕΔΙΠ) Ελένη Καλαμπαλίκη (ΕΤΕΠ) Ευθύμιος Χονδρογιάννης (Εξωτερικός Διδάσκοντας)

3ο Μέλος Επιτροπής --------- Ηλίας Παναγιωτόπουλος (Εξωτερικός Διδάσκων) Συμεών Παπαδόπουλος (Ερευνητής Γ' Βαθμίδας) Γιώργος Χατζηθανάσης (Εξωτερικός Διδάσκων) Ευαγγελία Φιλιοπούλου (Διδάσκων (με απόσπαση)) Δημοσθένης Κωτσόπουλος (Εξωτερικός Διδάσκων) Ιωάννης Κοντόπουλος (Εξωτερικός Διδάσκων) Γεώργιος Κάπος (Εξωτερικός Διδάσκων) Κωσταντίνα Βασιλοπούλου (Λέκτορας) Κωνσταντίνος Τσερπές (Αναπληρωτής Καθηγητής) Άγγελος Χαραλαμπίδης (Επίκουρος Καθηγητής) Δημοσθένης Αναγνωστόπουλος (Καθηγητής) Γεώργιος Μαλινδρέτος (Εξωτερικός Διδάσκων) Σωτήρης Ξύδης (Επίκουρος Καθηγητής) Γεώργιος Πετρόπουλος (Επίκουρος Καθηγητής) Θωμάς Καμαλάκης (Καθηγητής) Παναγιώτης Ριζομυλιώτης (Αναπληρωτής Καθηγητής) Χρύσα Σοφιανοπούλου (Καθηγήτρια) Ιωάννης Βιόλος (Εξωτερικός Διδάσκων) Ηρακλής Βαρλάμης (Καθηγητής) Μαυρέτα Σταμάτη (Αναπληρώτρια Καθηγήτρια) Παναγιώτης Κουρουθανάσης (Εξωτερικός Διδάσκων) Γεώργιος Παπαδόπουλος (Επίκουρος Καθηγητής) Φωτεινή Δανελη (ΕΤΕΠ) Γεώργιος Δημητρακόπουλος (Καθηγητής) Ηλίας Κατσαγούνος (Εξωτερικός Διδάσκων) Κλεοπάτρα Μπαρδάκη (Αναπληρώτρια Καθηγήτρια) Αντώνης Μακρής (Εξωτερικός Διδάσκων) Γεωργία Δέδε (Επίκουρη Καθηγήτρια) Ναούμ Μυλωνάς (Εξωτερικός Διδάσκων) Αδαμαντία Πατέλη (Εξωτερικός Διδάσκων) Ειρήνη Λιώτου (Επίκουρη Καθηγήτρια) Δήμητρα Λυπιτάκη (Εξωτερική Διδάσκεων) Χρήστος Δίου (Αναπληρωτής Καθηγητής) Αλέξανδρος Δημόπουλος (Εξωτερικός Διδάσκων) Μαλβίνα Βαμβακάρη (Καθηγητής) Γεώργιος Κουσιουρής (Αναπληρωτής Καθηγητής) Γιώργος Φραγκιαδάκης (Εξωτερικός Διδάσκων) Σπυριδούλα Λάκκα (Εξωτερικός Διδάσκων) Χρήστος Σαρδιανός (Εξωτερικός Διδάσκων) Νικόλαος Γεωργόπουλος (Εξωτερικός Διδάσκων) Κωνσταντίνος Βασιλάκης (Εξωτερικός Διδάσκων) Μάρα Νικολαίδου (Καθηγητής) Ιωάννης Ρούτης (Εξωτερικός Διδάσκων) Ανάργυρος Τσαδήμας (ΕΔΙΠ) Χρύσα Αγαπητού (Εξωτερικός Διδάσκων) Βασίλειος Ευθυμίου (Επίκουρος Καθηγητής) Χρήστος Μιχαλακέλης (Αναπληρωτής Καθηγητής) Δημήτριος Μιχαήλ (Αναπληρωτής Καθηγητής) Ευαγγελία Δράκου (Επίκουρη Καθηγήτρια) Νεκτάριος Μακρυδάκης (Εξωτερικός Διδάσκων) Παναγιώτης Μιχαήλ (Εξωτερικός Διδάσκοντας) Χρήστος Ανδρίκος (Εξωτερικός Διδάσκων) Νίκος Ζομπάκης (Εξωτερικός Διδάσκων) Αλεξάνδρα Γασπαρινάτου (ΕΔΙΠ) Αντωνία Ματάλα (Καθηγήτρια) Αικατερίνη Αντωνοπούλου (Αναπληρώτρια Καθηγήτρια) Ιωάννης Πάγκαλος (Επίκουρος Καθηγητής) Δημήτριος Ζμπαινος (Αναπλ. Καθηγητής) Βασίλειος Δαλάκας (ΕΔΙΠ) Ελένη Καλαμπαλίκη (ΕΤΕΠ) Ευθύμιος Χονδρογιάννης (Εξωτερικός Διδάσκοντας)